Identifiant PLACE de l'annonce :
693577
Métadonnée "org_acronym" :
s2d
Métadonnée "reference" : INRAEBDX12022101
Métadonnée "intitule" : Prestation en bioinformatique
Métadonnée "objet" : Analyse bioinformatique du génome et transcriptome du hêtre. Il s’agira notamment :
1/ d’identifier les polymorphismes SNP à partir du séquençage en pool et individuelle de plusieurs populations (France, Europe) sur la base de séquençage Illumina et d’une chaîne d’analyse bioinformatique disponible (croisant plusieurs méthodes de détection de variant (GATK, Samtools/BcfTools, FreeBayes,...)),
2/ d’analyser le transcriptome du hêtre au regard d’une mutation induisant un phénotype tortillard
3/ de contribuer à l’annotation du génome (modèle de gènes sur des gènes candidats pour la mutation).
Cette prestation nécessitera une interaction hebdomadaire entre le prestataire et les chercheurs de l’UMR ; idéalement sur site (33610 Cestas) pendant environ 4 mois au cours du 1er semestre 2021.
Lieu d’exécution des prestations :
INRAE UMR BIOGECO
69 Route d’Arcachon
33612 Cestas
Métadonnée "organisme" : inconnu (récupéré avant le 2 juillet 2023)
Date du téléchargement depuis PLACE :
2021-01-16T06:53:18.587000
Liens BOAMP :
b137d52bb287de715f5fbc87510acb32.pdf (41655)
Référence du réglement : NjkzNTc3
rc Bioinformatique Biogeco.pdf (168160)
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